阿米巴组织结构设计实质上是一个组织变革的过程。它是把企业的任务、流程、权力和责任重新进行有效组合和协调的一种活动。根据时代和市场的变化，进行阿米巴组织结构设计的结果是大幅度地提高企业的运行效率和经济效益。阿米巴组织结构设计的主要内容包括：

　　1.职能设计

　　职能设计是指阿米巴的经营职能和管理职能的设计。阿米巴作为一个经营单位，要根据其战略任务设计经营、管理职能。如果阿米巴的有些职能不合理，那就需要进行调整，对其弱化或取消。

　　2.框架设计

　　框架设计是阿米巴组织设计的主要部分，运用较多。其内容简单来说就是纵向的分层次、横向的分部门。一般可分为三级阿米巴。

　　3.协调设计

　　协调设计是指阿米巴协调方式的设计。框架设计主要研究分工，有分工就必须要有协作。协调方式的设计就是研究分工的各个层次、各个阿米巴之间如何进行合理的协调、联系、配合，以保证其高效率的配合，发挥管理系统的整体效应。

　　4.规范设计

　　规范设计就是管理规范的设计。管理规范就是企业的规章制度，它是管理的规范和准则。结构本身设计最后要落实并体现为规章制度。管理规范保证了各个层次的阿米巴和岗位，按照统一的要求和标准进行合作和行动。

　　5.人员设计

　　阿米巴组织架构设计和规范设计，都要以管理者为依托，并由阿米巴管理者来执行。因此，按照阿米巴组织设计的要求，必须进行人员设计，配备相应数量和质量的人员。